אחרי שנים על המדף, המוטנטים החדשים סוף סוף הגיע לבתי הקולנוע, אם כי בעיצומה של הזמן הגרוע ביותר ללכת לבית קולנוע בפועל. כך או כך, הסרט למעשה כאן, ומאפשר למעריצים של אקס-מן לראות מה פוקס תכנן לקבוצה זו של מוטציות צעירות עוד כשאולפן הקולנוע שלו עדיין היה קיים. אולם מאז שדיסני רכשה את פוקס, החדש מוטציות הוא הסרט האחרון של אותה זיכיון אקס-מן, והוא משאיר הרבה שאלות על הזיכיון ללא מענה. ראה, כפי שמתברר, המוטנטים החדשים קשורה קצת יותר לסרטים האחרים מהזיכיון, באופן ספציפי איקס- גברים: אפוקליפסה ו לוגן .
אזהרה: מאמר זה מכיל ספוילרים עבור המוטנטים החדשים! המשך לקרוא על אחריותך בלבד ...
כמו אקס מן: אַפּוֹקָלִיפּסָה ו לוגן - שתי דמויות מארוול שונות מאוד על הקצוות האחרים של הספקטרום האיכותי - המוטנטים החדשים קושר ישירות לנבל הקלאסי מיסטר סיניסטר. בשלב מסוים, כשכל הסרטים הללו נדונו, פוקס ככל הנראה התכוון להקים סיפור ארכיטקטורי, שבסופו של דבר הציג את סיניסטר כרע הגדול של הזיכיון, אך מעולם לא יצא לפועל.
בְּמֶשֶך מוטציות חדשות , ד'ר רייס מזכיר שוב ושוב את 'סופריור' שלה מבלי לחשוף את זהותם בפועל. הובהר שמי שאינו רייס שומר על כל המתקן. כל המתבגרים חושבים שהיא עובדת עבור צ'ארלס אקסבייר ואקס-מן, וכי הם יישלחו לעבוד עם האקס-מן ברגע שהם ישתלטו על כוחותיהם. עם זאת, מאוחר יותר התגלה כי רייס עובד למעשה עבור חברת אסקס קורפ.
שמו האמיתי של סיניסטר הוא נתיאל אסקס, והוא ייסד את חברת אסקס לחקר והכשרת מוטציות. אסקס מתגרים בסצנה שלאחר זיכויים של אַפּוֹקָלִיפּסָה כשקבוצת גברים מופיעה למתקן נשק X כדי לגנוב את ה- DNA של וולברין. בלוגן, חברת אסקס עומדת מאחורי הקמת ה- X-23. ב מוטציות חדשות , דניאל מונסטאר רואה זיכרונות ממקום בו בודקים מוטציות צעירות, וזה נראה כמעט בדיוק כמו המקום בו נוצר X-23.
ככל הנראה כל הסרטים האלה נבנו לקראת הצגתו של מרושע בעתיד, אבל זה לא יקרה עכשיו. הזכויות על ה- X-Men, ועל Sinister, אינן בידי קווין פייג ואולפני מארוול.